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FASTA

Índice FASTA

FASTA é um pacote de software para alinhamento de seqüências de ADN e proteínas descrito primeiramente (como FASTP) por David J. Lipman e William R. Pearson em 1985.

Índice

  1. 16 relações: Algoritmo de Smith-Waterman, Alinhamento de sequências, Ácido desoxirribonucleico, Bioinformática, BLAST, Clustal, Filogenética computacional, Formato FASTA, Heurística, Homologia (biologia), Linux, Macintosh, Microsoft Windows, Proteína, T-Coffee, Unix.

Algoritmo de Smith-Waterman

O Algoritmo de Smith-Waterman é um algoritmo bem conhecido para a realização de alinhamento de seqüências local; isto é, é elaborado para determinar as regiões similares entre duas seqüências de nucleotídeos ou duas seqüências de proteínas.

Ver FASTA e Algoritmo de Smith-Waterman

Alinhamento de sequências

Na bioinformática, alinhamento de sequência é uma técnica de organizar as sequências de DNA, RNA ou proteína para identificar regiões de similaridade que podem ser consequência de relações funcionais, estruturais ou evolutivas entre as sequências.

Ver FASTA e Alinhamento de sequências

Ácido desoxirribonucleico

Estrutura de um ADN Animação de um ADN de dupla hélice O ácido desoxirribonucleico (ADN, em português: ácido desoxirribonucleico; ou DNA, em inglês: deoxyribonucleic acid) é um polímero composto por duas cadeias polinucleotídicas que se enrolam umas sobre as outras para formar uma dupla hélice.

Ver FASTA e Ácido desoxirribonucleico

Bioinformática

Mapa do cromossomo X humano (a partir do site NCBI). O mapeamento do genoma humano é uma das maiores conquistas da bioinformática Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia.

Ver FASTA e Bioinformática

BLAST

BLAST (sigla em inglês que significa: Basic Local Alignment Search Tool), é um algoritmo para comparar informações de sequências biológicas primárias, tais como seqüências de aminoácidos de diferentes proteínas ou nucleotídeos de seqüencias de DNA.

Ver FASTA e BLAST

Clustal

Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.

Ver FASTA e Clustal

Filogenética computacional

Filogenética computacional é a aplicação de algoritmos computacionais, métodos e programas para a análise filogenética.

Ver FASTA e Filogenética computacional

Formato FASTA

Em bioinformática, o formato FASTA é um formato baseado em texto para representar tanto sequencias de nucleótidos quanto sequencias de peptídeos, no qual os nucleotídeos ou aminoácidos são representados usando códigos de uma única letra.

Ver FASTA e Formato FASTA

Heurística

Heurística é um procedimento mental simples que ajuda a encontrar respostas adequadas, embora várias vezes imperfeitas, para perguntas difíceis.

Ver FASTA e Heurística

Homologia (biologia)

Homologia de vários ossos (mostrados em cores diferentes) dos membros anteriores de quatro vertebrados. Homologia (do grego ομοως, "igualmente" e λοlÄγος, "ciência", "razão")AMORIM, Dalton de Sousa.

Ver FASTA e Homologia (biologia)

Linux

Linux é um termo popularmente empregado para se referir a que utilizam o núcleo Linux.

Ver FASTA e Linux

Macintosh

Diferentes computadores Macintosh. Macintosh (comumente abreviado para Mac desde 1998) é uma linha de computadores pessoais fabricados e comercializados pela empresa Apple Inc. desde janeiro de 1984.

Ver FASTA e Macintosh

Microsoft Windows

Microsoft Windows (ou simplesmente Windows) é uma família de sistemas operacionais desenvolvidos, comercializados e vendidos pela Microsoft.

Ver FASTA e Microsoft Windows

Proteína

Proteínas são macromoléculas biológicas constituídas por uma ou mais cadeias de aminoácidos.

Ver FASTA e Proteína

T-Coffee

T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) é um software de alinhamento múltiplo de sequências que usa uma abordagem progressiva.

Ver FASTA e T-Coffee

Unix

Unix é um sistema operativo portável, multitarefa e multiutilizador originalmente criado por Ken Thompson, Dennis Ritchie, entre outros, que trabalhavam nos Laboratórios Bell da AT&T.

Ver FASTA e Unix