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Gráfico de Ramachandran

Índice Gráfico de Ramachandran

O Gráfico de Ramachandran, ou Diagrama de Ramachandran ou plot, é um gráfico da bioquímica que representa todas as combinações possíveis de ângulos diédricos Ψ (psi) versus os φ (phi) nos aminoácidos de um polipeptídeo, as combinações mais estáveis de ângulos C alfa-N e C alfa-C, permitindo determinar a possível estrutura secundária da biomolécula peptídeo (formada pela ligação de dois ou mais aminoácidos) e a forma final (conformação) das estruturas das proteínas.

31 relações: Aminoácido, Aminoácido proteinogénico, Átomo, Bioinformática, Bioquímica, Biotecnologia, Código genético, Conformação nativa, Cristalografia de raios X, Diedro, Domínio (matemática), Efeito estérico, Energia, Estrutura da proteína, Função (matemática), G.N. Ramachandran, Glicina, Indianos, Isomerismo conformacional, Ligação química, Lista de bioquímicos, Max Born, Molécula, Orbital atômico, Peptídeo, Polipeptídeo, Princípio de exclusão de Pauli, Prolina, Protein Data Bank, Toro (topologia), Visual Molecular Dynamics.

Aminoácido

Aminoácidos são compostos de carbono (C), hidrogênio (H), oxigênio (O) e nitrogênio (N) - também chamado de azoto em Portugal - e alguns contêm enxofre (S), como a metionina e a cisteína.

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Aminoácido proteinogénico

são aminoácidos precursores das proteínas que são produzidos pelas células mediante o código genético de cada organismo.

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Átomo

Átomo é uma unidade básica de matéria que consiste num núcleo central de carga elétrica positiva envolto por uma nuvem de eletrões de carga negativa.

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Bioinformática

Mapa do cromossomo X humano (a partir do site NCBI). O mapeamento do genoma humano é uma das maiores conquistas da bioinformática Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia.

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Bioquímica

Exemplo de proteína, uma das classes de compostos bioquímicos mais abundantesLaboratório de bioquímica. Bioquímica (química aplicada à biologia) é a ciência e tecnologia que estuda e aplica as ciências químicas ao contexto da biologia, sendo portanto uma área interdisciplinar entre a química e a biologia.

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Biotecnologia

Biotecnologia (biologia aplicada) é a tecnologia baseada nas ciências biológicas, em qualquer nível: molecular, celular, morfofisiológico, ecológico, biodiversidade, reprodução e genética.

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Código genético

Código genético é a relação entre a sequência de bases no DNA e a sequência correspondente de aminoácidos, na proteína.

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Conformação nativa

A conformação nativa de uma proteína ou de um ácido nucleico denomina a estrutura tridimensional na qual essa molécula está biologicamente ativa e apresenta propriedades biológicas naturais.

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Cristalografia de raios X

Determinação de uma estrutura por cristalografia de raios X A cristalografia de raios X é uma técnica que consiste em fazer passar um feixe de raios X, uma forma de radiação eletromagnética, através de um cristal da substância sujeita ao estudo.

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Diedro

Em geometria, diedro, ângulo diedro ou ângulo diédrico é uma expansão do conceito de ângulo a um espaço tridimensional.

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Domínio (matemática)

Na matemática, e mais especificamente na teoria ingênua dos conjuntos, o domínio de definição (ou simplesmente o domínio) de uma função é o conjunto de valores de "entrada" ou argumento para os quais a função é definida.

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Efeito estérico

Os efeitos estéricos resultam de forças repulsivas entre nuvens de elétrons sobrepostas.

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Energia

renovável, da energia que as plantas usam para crescer até a que usamos para viver, todas têm por fonte primária a energia solar. São raros os processos na superfície da Terra que não se ligam de alguma forma à energia solar. Em ciência, energia (do grego ἐνέργεια, transl. enérgeia, no sentido de 'força em ação', de έν, "em, dentro", e εργον,ROMIZI, Renato. Greco antico. Vocabolario Greco Italiano Etimologico e Ragionato. Bologna: Zanichelli, 2006. ISBN 88-08-08915-0 "trabalho, obra, ação") ISBN 978-85-88381-41-4 refere-se a uma das duas grandezas físicas necessárias à correta descrição do inter-relacionamento - sempre mútuo - entre dois entes ou sistemas físicos.

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Estrutura da proteína

Estrutura da proteína ou estrutura proteica é o arranjo tridimensional de átomos em uma molécula de cadeia de aminoácidos.

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Função (matemática)

Uma função não injetiva e não sobrejetiva do domínio X para o contradomínio Y. A função é não injetova pois há dois elementos do domínio ligados a um mesmo elemento do contradomínio (cor vermelha). A função é não sobrejetiva pois há elementos de Y sem correspondentes em X (cores azul e lilás). Uma função é uma relação de um conjunto A com um conjunto B. Denotamos uma função por f:A\to B, y.

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G.N. Ramachandran

Gopalasamudram Narayana Iyer Ramachandran (Ernakulam, – Chennai) foi um físico hindiano, que mostrou que os aminoácidos estão limitados a um número finito de conformações.

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Glicina

A glicina (do grego glykos, "doce", nome devido ao seu sabor adocicado) é um dos aminoácidos codificados pelo código genético, sendo, portanto, um dos componentes das proteínas dos seres vivos.

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Indianos

Indianos são os cidadãos da Índia, a nação mais populosa do mundo, contendo 17,50% da população mundial.

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Isomerismo conformacional

Rotação sobre ligação simples de butano para interconverter um confórmero em outro. Acima: projeção de Newman; abaixo: descrição da orientação espacial. Em química orgânica, isomerismo conformacional(ou formulas conformacionais) é uma forma de estereoisomerismo na qual isômeros da mesma molécula podem ser interconvertidos formalmente a temperatura ambiente apenas por rotações sobre ligações simples C-C (consulte a figura na rotação de ligação simples).

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Ligação química

Ligações químicas são conjunções estabelecidas entre átomos para formarem moléculas ou, no caso de ligações iônicas ou metálicas, agregados atômicos (superátomos) organizados de forma a constituírem a estrutura básica de uma substância ou composto.

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Lista de bioquímicos

Esta é uma lista de bioquímicos que contribuiram relevantemente com a ciência.

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Max Born

Max Born (Breslávia, 11 de dezembro de 1882 — Göttingen, 5 de janeiro de 1970) foi um físico e matemático alemão, que foi fundamental para o desenvolvimento da mecânica quântica.

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Molécula

Uma molécula é um grupo eletricamente neutro que possui pelo menos dois átomos, todos ligados entre si mediante uma ligação covalente.

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Orbital atômico

Orbitais atómicas de um átomo é a denominação dos estados estacionários da função de onda de um elétron (funções próprias do hamiltoniano (H) na equação de Schrödinger H \psi.

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Peptídeo

Os peptídios, peptídeos ou péptidos são biomoléculas formadas pela ligação de dois ou mais aminoácidos atrávés de ligações peptídicas, estabelecidas entre um grupo amina de um aminoácido, e um grupo carboxilo do outro aminoácido.

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Polipeptídeo

As proteínas são compostos orgânicos formados pela associação de alfa-aminoácidos.

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Princípio de exclusão de Pauli

O princípio de exclusão de Pauli é um princípio da mecânica quântica formulado por Wolfgang Pauli em 1925.

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Prolina

A prolina (símbolo Pro ou P) é um aminoácido proteinogênico utilizado na biossíntese de proteínas.

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Protein Data Bank

O PDB (Protein Data Bank; em português: Banco de Dados de Proteínas) é um banco de dados em 3D de proteínas e ácidos nucléicos.

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Toro (topologia)

Animação Toróide Toro ou toróide é um espaço topológico homeomorfo ao produto de dois círculos.

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Visual Molecular Dynamics

O Visual molecular dynamics (VMD) é um programa de computador para modelagem molecular e visualização.

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Redireciona aqui:

Diagrama de Ramachandran.

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