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BLOSUM

Índice BLOSUM

A Matriz BLOSUM62 A matriz BLOSUM (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix) é uma matriz de substituição usada para o alinhamento de sequências de proteínas.

7 relações: Alinhamento de sequências, Aminoácido, Filogenética computacional, Matriz de substituição, Matrizes PAM, Proteína, Razão de possibilidades.

Alinhamento de sequências

Na bioinformática, alinhamento de sequência é uma técnica de organizar as sequências de DNA, RNA ou proteína para identificar regiões de similaridade que podem ser consequência de relações funcionais, estruturais ou evolutivas entre as sequências.

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Aminoácido

Aminoácidos são compostos de carbono (C), hidrogênio (H), oxigênio (O) e nitrogênio (N) - também chamado de azoto em Portugal - e alguns contêm enxofre (S), como a metionina e a cisteína.

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Filogenética computacional

Filogenética computacional é a aplicação de algoritmos computacionais, métodos e programas para a análise filogenética.

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Matriz de substituição

Matriz PAM70 para 23 aminoácidos, calculada com o http://www.bioinformatics.nl/tools/pam.html serviço web do ''Wageningen University Laboratory of Bioinformatics'' (Laboratório de Bioinformática da Universidade de Wageningen) para tal fim. Em bioinformática e biologia evolutiva uma matriz de substituição, ou de pontuação, descrive o ritmo em que um caráter em uma sequência altera-se a outro caráter com o tempo.

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Matrizes PAM

Matriz PAM70, calculada com o http://www.bioinformatics.nl/tools/pam.html serviço web do ''Wageningen University Laboratory of Bioinformatics'' para tal fim; neste caso são representados 23 aminoácidos. Matrizes PAM, ou conjunto de matrizes PAM, de Point Accepted Mutation (do inglês, mutação pontual aceita), também Percent Accepted Mutation (porcentagem de mutação aceita), e também matriz de dados de mutação de Dayhoff ou MD, é um conjunto de matrizes de mutação de peptídeos, ou matrizes de substituição, calculado por Margaret Dayhoff ao final dos anos 1970, no que se converteria em um trabalho determinante no campo da bioinformática.

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Proteína

Proteínas são macromoléculas biológicas constituídas por uma ou mais cadeias de aminoácidos.

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Razão de possibilidades

A razão de chances ou razão de possibilidades (odds ratio; abreviatura O.R.) é definida como a razão entre a chance de um evento ocorrer em um grupo e a chance de ocorrer em outro grupo.

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