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DIALIGN-TX e T-Coffee

Atalhos: Diferenças, Semelhanças, Coeficiente de Similaridade de Jaccard, Referências.

Diferença entre DIALIGN-TX e T-Coffee

DIALIGN-TX vs. T-Coffee

DIALIGN-TX é um programa de alinhamento múltiplo de seqüência escrita por Amarendran R. Subramanian e é uma melhoria substancial do DIALIGN-T, combinando estratégias de alinhamento gananciosas e progressivas em um novo algoritmo. T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) é um software de alinhamento múltiplo de sequências que usa uma abordagem progressiva.

Semelhanças entre DIALIGN-TX e T-Coffee

DIALIGN-TX e T-Coffee têm 8 coisas em comum (em Unionpedia): Alinhamento múltiplo de sequências, Bioinformática, Clustal, Filogenética computacional, MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis, MUSCLE, PAUP, PHYLIP.

Alinhamento múltiplo de sequências

Alinhamento múltiplo de 27 sequências da proteína hemaglutinina da gripe aviária, colorado segundo a conservação de resíduos (mais escuro quanto maior conservação, acima) e suas propriedades químicas (abaixo). Um alinhamento múltiplo de sequências é um alinhamento de três ou mais sequências biológicas, geralmente proteínas, ADN ou ARN.

Alinhamento múltiplo de sequências e DIALIGN-TX · Alinhamento múltiplo de sequências e T-Coffee · Veja mais »

Bioinformática

Mapa do cromossomo X humano (a partir do site NCBI). O mapeamento do genoma humano é uma das maiores conquistas da bioinformática Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia.

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Clustal

Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.

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Filogenética computacional

Filogenética computacional é a aplicação de algoritmos computacionais, métodos e programas para a análise filogenética.

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MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis

MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis, é um software livre disponível para ajudar cientistas e estudantes na elaboração de dendrogramas ou árvores filogenéticas usando sequências de nucleótidos ou proteínas.

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MUSCLE

MUSCLE é frequentemente utilizado como um substituto para o Clustal, uma vez que normalmente (mas não sempre) dá melhor alinhamentos de seqüência e, além disso, o MUSCLE é significativamente mais rápido do que o Clustal, especialmente para alinhamentos maiores (Edgar 2004).

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PAUP

PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony) é um programa de filogenia computacional para inferir árvores evolutivas (filogenias), escrito por David L. Swofford.

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PHYLIP

PHYLIP (PHYLogeny Inference Package) é um pacote de programas de filogenética computacional, de licença livre, para inferência de árvores evolucionárias (filogenias).

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A lista acima responda às seguintes perguntas

Comparação entre DIALIGN-TX e T-Coffee

DIALIGN-TX tem 9 relações, enquanto T-Coffee tem 17. Como eles têm em comum 8, o índice de Jaccard é 30.77% = 8 / (9 + 17).

Referências

Este artigo é a relação entre DIALIGN-TX e T-Coffee. Para acessar cada artigo visite:

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