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18 relações: Alinhamento de sequências, Alinhamento estrutural, Ácido desoxirribonucleico, Biopython, Clustal, DIALIGN-TX, Filogenética computacional, HMMER, Informação mútua, Jogo de computação baseado em humanos, MAFFT, Mapa de contato de proteína, Matrizes PAM, Paráfrase (linguística computacional), Pfam, Sequência conservada, Software de alinhamento de sequências, T-Coffee.
Alinhamento de sequências
Na bioinformática, alinhamento de sequência é uma técnica de organizar as sequências de DNA, RNA ou proteína para identificar regiões de similaridade que podem ser consequência de relações funcionais, estruturais ou evolutivas entre as sequências.
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Alinhamento estrutural
Um alinhamento estrutural é um tipo de alinhamento de sequências baseado na comparação da forma das moléculas.
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Ácido desoxirribonucleico
Estrutura de um ADN Animação de um ADN de dupla hélice O ácido desoxirribonucleico (ADN, em português: ácido desoxirribonucleico; ou DNA, em inglês: deoxyribonucleic acid) é um polímero composto por duas cadeias polinucleotídicas que se enrolam umas sobre as outras para formar uma dupla hélice.
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Biopython
Biopython é uma biblioteca ou uma suite de ferramentas escritas em Python para manipulação de dados biológicos.
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Clustal
Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.
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DIALIGN-TX
DIALIGN-TX é um programa de alinhamento múltiplo de seqüência escrita por Amarendran R. Subramanian e é uma melhoria substancial do DIALIGN-T, combinando estratégias de alinhamento gananciosas e progressivas em um novo algoritmo.
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Filogenética computacional
Filogenética computacional é a aplicação de algoritmos computacionais, métodos e programas para a análise filogenética.
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HMMER
HMMER é um e pacote de software livre comumente usado para análise de sequência escrito por Sean Eddy.
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Informação mútua
Diagrama mostrando as relações aditivas e subtrativas de várias medidas de informação associadas com as variaveis correlacionadas ''X'' e ''Y''. A área contida pelos dois círculos é a entropia conjunta Η(''X'',''Y''). O círculo na esquerda (vermelho e violeta) é a entropia individual H(''X''), sendo o círculo vermelho a entropia condicional Η(''X''|''Y''). O círculo na direita (azul e violeta) é H(''Y''), sendo o azul Η(''Y''|''X''). O círculo violeta é a informação mútua ''I''(''X'';''Y'') Em teoria das probabilidades e teoria da informação, a informação mútua (em inglês MI de:en:Mutual information) de duas variáveis aleatórias é a medida da dependência mútua entre as duas variáveis.
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Jogo de computação baseado em humanos
Um jogo de computação baseado em humanos ou um jogo com propósito (em inglês GWAP) é uma técnica de computação humana de terceirização de etapas de um processo computacional para seres humanos de uma maneira divertida (ludificação).
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MAFFT
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.
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Mapa de contato de proteína
Um mapa de contato de proteína representa a distância entre todos os possíveis pares de resíduos de aminoácidos de uma estrutura de proteína tridimensional usando uma matriz bidimensional binária.
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Matrizes PAM
Matriz PAM70, calculada com o http://www.bioinformatics.nl/tools/pam.html serviço web do ''Wageningen University Laboratory of Bioinformatics'' para tal fim; neste caso são representados 23 aminoácidos. Matrizes PAM, ou conjunto de matrizes PAM, de Point Accepted Mutation (do inglês, mutação pontual aceita), também Percent Accepted Mutation (porcentagem de mutação aceita), e também matriz de dados de mutação de Dayhoff ou MD, é um conjunto de matrizes de mutação de peptídeos, ou matrizes de substituição, calculado por Margaret Dayhoff ao final dos anos 1970, no que se converteria em um trabalho determinante no campo da bioinformática.
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Paráfrase (linguística computacional)
A paráfrase ou o parafraseamento em linguística computacional é a tarefa de processamento de linguagem natural de detectar e gerar paráfrases.
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Pfam
Pfam é uma base de dados de famílias de proteínas em que constam as sua anotações e alinhamentos múltiplos de sequências gerados com base nos modelos ocultos de Markov.
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Sequência conservada
urlmorta.
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Software de alinhamento de sequências
Esta lista de software de alinhamento de sequências é uma compilação de ferramentas software e portais web usados em alinhamento de sequências de pares e alinhamento múltiplo de sequências.
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T-Coffee
T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) é um software de alinhamento múltiplo de sequências que usa uma abordagem progressiva.
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