9 relações: Alinhamento múltiplo de sequências, Biopython, Clustal, DIALIGN-TX, FASTA, MAFFT, MUSCLE, Software de alinhamento de sequências, SplitsTree.
Alinhamento múltiplo de sequências
Alinhamento múltiplo de 27 sequências da proteína hemaglutinina da gripe aviária, colorado segundo a conservação de resíduos (mais escuro quanto maior conservação, acima) e suas propriedades químicas (abaixo). Um alinhamento múltiplo de sequências é um alinhamento de três ou mais sequências biológicas, geralmente proteínas, ADN ou ARN.
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Biopython
Biopython é uma biblioteca ou uma suite de ferramentas escritas em Python para manipulação de dados biológicos.
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Clustal
Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.
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DIALIGN-TX
DIALIGN-TX é um programa de alinhamento múltiplo de seqüência escrita por Amarendran R. Subramanian e é uma melhoria substancial do DIALIGN-T, combinando estratégias de alinhamento gananciosas e progressivas em um novo algoritmo.
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FASTA
FASTA é um pacote de software para alinhamento de seqüências de ADN e proteínas descrito primeiramente (como FASTP) por David J. Lipman e William R. Pearson em 1985.
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MAFFT
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.
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MUSCLE
MUSCLE é frequentemente utilizado como um substituto para o Clustal, uma vez que normalmente (mas não sempre) dá melhor alinhamentos de seqüência e, além disso, o MUSCLE é significativamente mais rápido do que o Clustal, especialmente para alinhamentos maiores (Edgar 2004).
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Software de alinhamento de sequências
Esta lista de software de alinhamento de sequências é uma compilação de ferramentas software e portais web usados em alinhamento de sequências de pares e alinhamento múltiplo de sequências.
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SplitsTree
SplitsTree é um programa popular para inferir árvores filogenéticas ou, mais genericamente, redes filogenéticas de vários tipos de dados, tais como a alinhamento de sequências, uma matriz de distâncias ou um conjunto de árvores.
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