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MUSCLE e T-Coffee

Atalhos: Diferenças, Semelhanças, Coeficiente de Similaridade de Jaccard, Referências.

Diferença entre MUSCLE e T-Coffee

MUSCLE vs. T-Coffee

MUSCLE é frequentemente utilizado como um substituto para o Clustal, uma vez que normalmente (mas não sempre) dá melhor alinhamentos de seqüência e, além disso, o MUSCLE é significativamente mais rápido do que o Clustal, especialmente para alinhamentos maiores (Edgar 2004). T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) é um software de alinhamento múltiplo de sequências que usa uma abordagem progressiva.

Semelhanças entre MUSCLE e T-Coffee

MUSCLE e T-Coffee têm 8 coisas em comum (em Unionpedia): Árvore filogenética, Clustal, Filogenética computacional, Filogenia, MAFFT, MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis, PAUP, PHYLIP.

Árvore filogenética

Fig. 1: Exemplo de Arvore Filogenética Uma árvore filogenética é uma representação gráfica, em forma de árvore, apresentando as relações evolutivas entre várias espécies ou outras entidades que possam ter um ancestral comum.

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Clustal

Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.

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Filogenética computacional

Filogenética computacional é a aplicação de algoritmos computacionais, métodos e programas para a análise filogenética.

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Filogenia

Em biologia, filogenia (ou filogênese) é o estudo da relação evolutiva entre grupos de organismos (por exemplo, espécies, populações), que é descoberto por meio de sequenciamento de dados moleculares e matrizes de dados morfológicos.

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MAFFT

MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.

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MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis

MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis, é um software livre disponível para ajudar cientistas e estudantes na elaboração de dendrogramas ou árvores filogenéticas usando sequências de nucleótidos ou proteínas.

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PAUP

PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony) é um programa de filogenia computacional para inferir árvores evolutivas (filogenias), escrito por David L. Swofford.

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PHYLIP

PHYLIP (PHYLogeny Inference Package) é um pacote de programas de filogenética computacional, de licença livre, para inferência de árvores evolucionárias (filogenias).

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A lista acima responda às seguintes perguntas

Comparação entre MUSCLE e T-Coffee

MUSCLE tem 10 relações, enquanto T-Coffee tem 17. Como eles têm em comum 8, o índice de Jaccard é 29.63% = 8 / (10 + 17).

Referências

Este artigo é a relação entre MUSCLE e T-Coffee. Para acessar cada artigo visite:

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