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BioJava

Índice BioJava

O projeto BioJava é um projeto de código aberto dedicado a fornecer ferramentas Java para o processamento de dados biológicos.

Índice

  1. 18 relações: Bioconductor, Bioinformática, Biologia, BioPerl, Biopython, BioRuby, Código aberto, CORBA, DAS, GNU Lesser General Public License, Interoperabilidade, Java (linguagem de programação), Macintosh, Microsoft Windows, Open Bioinformatics Foundation, Programação dinâmica, Projeto de software, Sistema operacional tipo Unix.

  2. Softwares de bioinformática

Bioconductor

O é um projeto de software livre, de código aberto e de desenvolvimento aberto para análise e compreensão de dados genômicos gerados por experimentos em laboratórios na área de biologia molecular.

Ver BioJava e Bioconductor

Bioinformática

Mapa do cromossomo X humano (a partir do site NCBI). O mapeamento do genoma humano é uma das maiores conquistas da bioinformática Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia.

Ver BioJava e Bioinformática

Biologia

Biologia é a ciência natural que estuda, descreve, preserva e melhora a vida e os organismos vivos.

Ver BioJava e Biologia

BioPerl

BioPerl é uma coleção de módulos Perl que facilitam o desenvolvimentode scripts Perl para aplcações de bioinformática.

Ver BioJava e BioPerl

Biopython

Biopython é uma biblioteca ou uma suite de ferramentas escritas em Python para manipulação de dados biológicos.

Ver BioJava e Biopython

BioRuby

BioRuby é um pacote de código aberto feito na linguagem Ruby, com classes para análise de seqüências de ADN e proteínas, alinhamento, análise sintática de bancos de dados, e outras ferramentas da Bioinformática.

Ver BioJava e BioRuby

Código aberto

Código aberto (do inglês Open Source) é o código-fonte que é disponibilizado gratuitamente para consulta, examinação, modificação e redistribuição.

Ver BioJava e Código aberto

CORBA

CORBA (abreviado de Common Object Request Broker Architecture) é a arquitetura padrão criada pelo Object Management Group para estabelecer e simplificar a troca de dados entre sistemas distribuídos heterogêneos.

Ver BioJava e CORBA

DAS

*Direct Attached Storage - um digital storage system conectado diretamente a um ou mais computadores sem uso de rede entre eles.

Ver BioJava e DAS

GNU Lesser General Public License

A GNU Lesser General Public License, escrita em 1991 (e atualizada em 1999), é uma licença de software livre aprovada pela FSF e escrita como um meio-termo entre a GPL e licenças mais permissivas, tais como a licença BSD e a licença MIT.

Ver BioJava e GNU Lesser General Public License

Interoperabilidade

Interoperabilidade é a capacidade de um sistema (informatizado ou não) de se comunicar de forma transparente (ou o mais próximo disso) com outro sistema (semelhante ou não).

Ver BioJava e Interoperabilidade

Java (linguagem de programação)

Java é uma linguagem de programação orientada a objetos desenvolvida na década de 90 por uma equipe de programadores chefiada por James Gosling, na empresa Sun Microsystems, que em 2008 foi adquirido pela empresa Oracle Corporation.

Ver BioJava e Java (linguagem de programação)

Macintosh

Diferentes computadores Macintosh. Macintosh (comumente abreviado para Mac desde 1998) é uma linha de computadores pessoais fabricados e comercializados pela empresa Apple Inc. desde janeiro de 1984.

Ver BioJava e Macintosh

Microsoft Windows

Microsoft Windows (ou simplesmente Windows) é uma família de sistemas operacionais desenvolvidos, comercializados e vendidos pela Microsoft.

Ver BioJava e Microsoft Windows

Open Bioinformatics Foundation

A Open Bioinformatics Foundation é uma organização sem fins lucrativos, voluntária focada em apoiar programação em código aberto na área de bioinformática.

Ver BioJava e Open Bioinformatics Foundation

Programação dinâmica

Programação dinâmica é um método para a construção de algoritmos para a resolução de problemas computacionais, em especial os de otimização combinatória.

Ver BioJava e Programação dinâmica

Projeto de software

Design de Software (do inglês Software design) é a parte da engenharia de software que se encarrega de fazer todo o planejamento anterior ao desenvolvimento, incluindo a definição da arquitetura do software, e transformar tudo em um documento ou conjunto de documentos capazes de serem interpretados diretamente pelo programador.

Ver BioJava e Projeto de software

Sistema operacional tipo Unix

Um sistema operacional do tipo Unix (Unix-like em inglês) referido também como UN*X ou *nix é um sistema similar ao Unix, não estando necessariamente de acordo com o Single UNIX Specification.

Ver BioJava e Sistema operacional tipo Unix

Ver também

Softwares de bioinformática