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Penalidade para lacunas

Índice Penalidade para lacunas

Penalidade para lacunas ou Penalidade para gaps (gap penalty) são usadas durante o alinhamento de seqüências.

7 relações: Algoritmo de Smith-Waterman, Algoritmo Needleman-Wunsch, Alinhamento de sequências, Deleção, Função afim, Inserção (genética), Matriz de similaridade.

Algoritmo de Smith-Waterman

O Algoritmo de Smith-Waterman é um algoritmo bem conhecido para a realização de alinhamento de seqüências local; isto é, é elaborado para determinar as regiões similares entre duas seqüências de nucleotídeos ou duas seqüências de proteínas.

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Algoritmo Needleman-Wunsch

O algoritmo Needleman–Wunsch tem por objetivo realizar o alinhamento de seqüências global de duas seqüências (denominadas aqui de A e B).

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Alinhamento de sequências

Na bioinformática, alinhamento de sequência é uma técnica de organizar as sequências de DNA, RNA ou proteína para identificar regiões de similaridade que podem ser consequência de relações funcionais, estruturais ou evolutivas entre as sequências.

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Deleção

Deleção em um cromossomo Deleção é a designação dada em genética à perda total ou parcial de um segmento do cromossomo.

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Função afim

Esquema explicativo de uma função afim. Exemplo de uma função afim. Uma função afim, também conhecida como função polinomial de grau 1 ou função polinomial de primeiro grau é uma função do tipo f(x).

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Inserção (genética)

Uma inserção genética é a adição de um ou mais pares de bases de nucleótidos em uma sequência genética.

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Matriz de similaridade

Uma matriz de similaridade é uma matriz de pontuação (escores) que expressa a similaridade entre dois pontos dados.

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